Công ty Đóng tàu Phà Rừng trước đây là Nhà máy Sửa chữa tàu biển Phà Rừng là công trình hợp tác giữa chính phủ Việt Nam và Cộng hoà Phần Lan được đưa vào hoạt động từ ngày 25 tháng 3 năm 1984. Ban đầu, Công ty được xây dựng để sửa chữa các loại tàu biển có trọng tải đến 15.000 tấn. Trải qua hơn 20 năm hoạt động, Công ty đã sửa chữa được gần ngàn lượt tàu trong nước và của các quốc gia danh tiếng trên thế giới như: Liên bang Nga, Đức, Hy Lạp, Hàn Quốc, Singapore... đạt chất lượng cao. Công ty là một trong những đơn vị đi đầu trong việc sửa chữa các loại tàu biển đòi hỏi kỹ thuật cao như tàu chở khí gas hoá lỏng, tàu phục vụ giàn khoan... Công ty Đóng tàu Phà Rừng là một trong những cơ sở hàng đầu của Việt Nam có thương hiệu và uy tín trong lĩnh vực sửa chữa tàu biển.
 Những năm gần đây, Công ty bắt đầu tham gia vào thị trường đóng mới. Công ty đã bàn giao cho khách hàng gần chục tàu có trọng tải từ 6500 tấn đến 12500 tấn. Đó là tiền đề để Công ty Đóng tàu Phà Rừng thực hiện các hợp đồng đóng mới các loại tàu có tính năng kỹ thuật cao để xuất khẩu như tàu chở dầu/hoá chất 6500 tấn cho Hàn Quốc, tàu chở hàng vỏ kép 34.000 tấn cho Vương Quốc Anh hiện đang được triển khai tại Công ty. Sản lượng và doanh thu năm 2006 của Công ty cao hơn 10 lần so với năm 2000. Kế hoạch năm 2007 Công ty phấn đấu giá trị tổng sản lượng đạt 1500 tỷ đồng, doanh thu trên 1.000 tỷ đồng.
 Thực hiện chiến lược phát triển kinh tế biển của Đảng, Nhà nước và của Tập đoàn Công nghiệp tàu thuỷ Việt Nam, Công ty đang thực hiện dự án xây dựng Công ty Đóng tàu Sông Giá có thể đóng tàu trọng tải đến 100.000 tấn, xây dựng cụm công nghiệp Vinashin Đình Vũ bao gồm hệ thống cảng biển và khu công nghiệp phụ trợ, xây dựng nhà máy đóng tàu và sửa chữa tàu tại Yên Hưng - Quảng Ninh...
 Hiện tại Công ty đóng tàu Phà Rừng bao gồm công ty mẹ, 5 công ty trách nhiệm hữu hạn một thành viên, 5 công ty cổ phần có vốn góp chi phối của Công ty, một trường dạy nghề. Trong thời gian tới số lượng các đơn vị thành viên sẽ là gần 20 đơn vị. Công ty Đóng tàu Phà Rừng sẽ trở thành Tổng Công ty Công nghiệp tàu thuỷ Phà Rừng.
 Hiện tại Công ty có gần 3000 CBCNV. Trong đó có 390 kỹ sư, cử nhân được đào tạo trong nước và nước ngoài. Công ty có trên 300 công nhân được đào tạo từ 2 đến 3 năm về công nghệ đóng mới tàu biển tại Nhật bản.
 Công ty đã xây dựng, áp dụng và duy trì hệ thống quản lý chất lượng theo tiêu chuẩn ISO 9001-2000 có hiệu lực và hiệu quả, đã được DET NOSKE VERITAS (DNV) đánh giá cấp chứng chỉ từ năm 2000.
 Với những thành tích đã đạt được Công ty đã được tặng thưởng: Huân chương độc lập hạng Ba (2005), Huân chương lao động hạng nhất (2004), Huân chương lao động hạng nhà (1992), Huân chương lao động hạng Ba ( 1987), 5 cờ thi đua của Chính phủ