Sở Công Thương Điện Biên là cơ quan chuyên môn thuộc Uỷ ban nhân dân tỉnh Điện Biên, có chức năng tham mưu, giúp Uỷ ban nhân dân tỉnh thực hiện chức năng quản lý nhà nước về công thương trên địa bàn tỉnh bao gồm các lĩnh vực: cơ khí; luyện kim; điện; năng lượng mới; năng lượng tái tạo; hóa chất; vật liệu nổ công nghiệp; công nghiệp khai thác mỏ và chế biến khoáng sản; công nghiệp tiêu dùng; công nghiệp thực phẩm; công nghiệp chế biến khác; lưu thông hàng hoá trên địa bàn tỉnh; xuất khẩu; nhập khẩu; thương mại biên giới; quản lý thị trường; quản lý cạnh tranh; xúc tiến thương mại; kiểm soát độc quyền; chống bán phá giá; chống trợ cấp, bảo vệ quyền lợi người tiêu dùng; thương mại điện tử; dịch vụ thương mại; hội nhập kinh tế; quản lý cụm, điểm công nghiệp; các hoạt động khuyến công; các dịch vụ công thuộc phạm vi quản lý của Sở trên địa bàn tỉnh, thực hiện một số nhiệm vụ, quyền hạn theo sự uỷ quyền của UBND tỉnh và theo quy định của pháp luật.

Cơ cấu tổ chức của Sở Công thương Điện Biên bao gồm:

1. Lãnh đạo Sở gồm: Giám đốc Sở và các Phó giám đốc Sở
2. Tổ chức tham mưu giúp Lãnh đạo Sở:

2.1. Các phòng chuyên môn, nghiệp vụ thuộc Sở:

Văn phòng
Thanh tra
Phòng Kế hoạch - Tài chính
Phòng quản lý Công nghiệp
Phòng quản lý Thương mại
Phòng kỹ thuật an toàn - Môi trường
Phòng Quản lý Điện năng
Phòng XNK và Mậu dịch biên giới .
2.2. Các đơn vị  trực thuộc Sở Công Thương:

Chi cục Quản lý thị trường
Trung tâm Khuyến công và Tư vấn phát triển công nghiệp.
Trung tâm Xúc tiến Thương mại.
Văn phòng đại diện Công Thương tại tỉnh Luang Phra Bang .
Ban quản lý Dự án chuyên ngành Công Thương.