Được thành lập từ những năm 1960, tiền thân của Công ty cổ phần giống cây trồng Bắc Ninh là Công ty giống cây trồng Hà Bắc (cũ) thuộc Sở Nông nghiệp và PTNT Hà Bắc. Đến năm 1997 khi tỉnh Bắc Ninh được tái lập, Công ty giống cây trồng Hà Bắc được chia tách thành Công ty giống cây trồng Bắc Ninh và Công ty giống cây trồng Bắc Giang. Công ty giống cây trồng Bắc Ninh được thành lập theo Quyết định số 43/QĐ - UB ngày 04/03/1997 “V/v: thành lập Công ty giống cây trồng Bắc Ninh”. Ban đầu cơ sở vật chất của công ty thiếu và yếu kém, nhất là tài sản như nhà kho, nhà làm việc cũ nát, không có phòng chuyên môn cho công tác kiểm nghiệm hạt giống, thị trường tiêu thụ hết sức mới mẻ,…
Thực hiện chính sách cổ phần hóa theo Quyết định số 03/2003/QĐ-UB ngày 10/11/2003 của Chủ tịch UBND Tỉnh Bắc Ninh V/v cổ phần hóa doanh nghiệp nhà nước. Đến ngày 15/9/2004 UBND Tỉnh Bắc Ninh ra quyết định số 1534/QĐ V/v phê duyệt phương án cổ phẩn hóa Công ty giống cây trồng Bắc Ninh thành Công ty cổ phần giống cây trồng Bắc Ninh.

Công ty cổ phần giống cây trồng Bắc Ninh rất có uy tín và thương hiệu trong lĩnh vực sản xuất, kinh doanh giống cây trồng, sản phẩm của công ty đã chiếm được lòng tin của bà con nông dân cả nước. Công ty có các đơn vị trực thuộc để nghiên cứu, chọn tạo và sản xuất hạt giống, có hệ thống máy móc tương đối hiện đại, dây chuyền chế biến giống khá đồng bộ để chế biến hạt giống đạt tiêu chuẩn chất lượng cao. Bên cạnh đó, Công ty luôn chú trọng đến công tác nghiên cứu phát triển các giống mới có chất lượng tốt hơn, năng suất cao hơn, ổn định để đáp ứng cầu ngày càng cao của bà con nông dân.

Năm 2006 Phòng kiểm nghiệm giống cây trồng của công ty được Bộ Nông nghiệp và PTNT công nhận, đã thực hiện hệ thống quản lý chất lượng theo tiêu chuẩn ISO/IEC 17025 : 2001.

Công ty có hệ thống đại lý phân phối ở hầu hết các địa phương trong cả nước, hàng năm cung ứng hơn hai nghìn tấn giống cây trồng các loại như: Giống lúa thuần, lúa lai, lạc, đỗ tương, khoai tây và hoa. Mặt khác công ty có được sự cộng tác của nhiều nhà khoa học đầu ngành trong lĩnh vực nghiên cứu giống hiện nay ở Việt Nam. Đây là những yếu tố chính tạo nên sức mạnh cạnh tranh của Công ty BSC trên thị trường. Trong những năm qua, doanh thu và lợi nhuận của các sản phẩm Lúa thuần, Lúa lai, luôn chiếm tỷ trọng cao (98%) trong tổng doanh thu và lợi nhuận của toàn công ty.khắc Phúc Ðăng Hoả, con nhà Bạch Ðế-Trường mạng. Ông Quan Đế độ mạng