Đến năm 2003, theo Quyết định số 67/2003/QĐ/BNN-TCCB ngày 11/6/2003 của Bộ Nông Nghiệp và Phát triển nông thôn, hai tổng công ty chuyên ngành của Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn về cơ điện và xây dựng công trình là Tổng công ty Cơ điện Nông nghiệp và Thủy lợi và Tổng công ty Xây dựng Thủy Lợi 1 được sáp nhập thành Tổng công ty Cơ điện, Xây dựng, Nông nghiệp và Thủy Lợi (AGRIMECO), tạo nên một tập đoàn kinh tế mạnh, đủ năng lực thực hiện những dự án lớn mang tầm cỡ quốc gia và quốc tế, đồng thời đóng vai trò là đơn vị chủ chốt đáp ứng những nhiệm vụ chính trị của Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn.

Tổng công ty có 20 đơn vị thành viên và gần 10.000 cán bộ, công nhân viên, trong đó có hơn 7.000 công nhân lành nghề, hàng trăm kỹ sư, tiến sỹ, thạc sỹ và cán bộ kỹ thuật là những chuyên gia giỏi, có kinh nghiệm về lĩnh vực cơ điện và xây dựng, có đủ trình độ năng lực thiết kế, chế tạo, lắp đặt và thi công các công trình thuỷ lợi và thuỷ điện lớn trong nước và quốc tế cả phần cơ điện và xây lắp.

Hệ thống trang thiết bị của AGRIMECO hiện đại và không ngừng được đầu tư đổi mới, bao gồm: Các loại máy gia công cơ khí công nghệ cao, các thiết bị khoan nổ mìn phá đá, thiết bị khoan phụt bê tông, trạm nghiền sàng đá, trạm trộn bê tông và các dây chuyền thi công bê tông, đất đá có công suất lớn, đáp ứng yêu cầu thi công nhanh với khối lượng lớn có yêu cầu kỹ thuật cao.

Các công trình lớn AGRIMECO đã trực tiếp thi công gồm có:

-          Tổng thầu thi công xây lắp Dự án Thuỷ điện sông Ba Hạ - Phú Yên

-          Công trình thuỷ lợi, thuỷ điện hồ chứa nước Cửa Đạt – Thanh Hoá

-          Thuỷ điện Pleikrong - Kon Tum

-          Thuỷ điện Thanh H’Chan - Gia Lai

-          Thuỷ điện Eakrongrau - Khánh Hoà

-          Thuỷ điện Sơn La

-          Thuỷ điện Sông Hinh

-          Đê lấn biển Kiên Giang

-          Kè chống xói lở Tân Châu - An Giang

-          Kè Xâm Thị - Hà Tây

-          Hồ chứa nước Dầu Tiếng- Tây Ninh

-          Đập dâng Tân Giang - Ninh Thuận

-          Trạm bơm Văn Đình - Hà Tây

-          Trạm bơm Gia Viễn - Ninh Bình

-          Công trình thủy điện Trị An

-          Thủy điện Thác Mơ

-          Thủy điện Kẻ Gỗ

-          Thủy điện Sông Hinh

-          Thủy điện Nậm Phao (Cộng hòa Dân chủ Nhân dân Lào)

-          Các công trình khác

Với truyền thống 50 năm và một đ­ường lối phát triển đúng đắn, AGRIMECO đã tạo dựng nên một thư­ơng hiệu có uy tín lớn, dẫn đầu về thiết kế, chế tạo máy móc thiết bị phục vụ nông nghiệp và thuỷ lợi và cơ khí thuỷ công tại Việt Nam, đồng thời luôn là một đối tác tin cậy đối với các doanh nghiệp trong và ngoài nước.

 Cơ khí:
- Thiết kế, chế tạo, lắp đặt và kinh doanh các loại phụ tùng, thiết bị, máy móc nông nghiệp, lâm nghiệp, thủy lợi, diêm nghiệp, công nghiệp chế biến, thủy điện, xây dựng và phương tiện vận tải;
- Thiết kế, chế tạo và lắp đặt các thiết bị nâng hạ;
- Sửa chữa, bảo dưỡng và phục hồi các loại thiết bị, phụ tùng, xe máy và máy công cụ.

 Kinh doanh điện:
- Thiết kế, chế tạo, xây dựng và lắp đặt điện phục vụ các công trình nông nghiệp, lâm nghiệp, diêm nghiệp, thủy lợi và phát triển nông thôn;
- Sản xuất và kinh doanh điện.

 Kinh doanh xây dựng:
- Đầu tư, xây dựng công trình nông nghiệp, lâm nghiệp, diêm nghiệp, thủy lợi, công nghiệp, dân dụng, giao thông, cơ sở hạ tầng nông thôn;
- Khảo sát, điều tra quy hoạch, lập dự án đầu tư xây dựng, thiết kế công trình nông, lâm nghiệp, diêm  nghiệp,thủy lợi lợi, thủy điện, dân dụng, nước sạch, vệ sinh môi trường, cấp thoát nước.
- Quản lý dự án đầu tư xây dựng, thẩm tra dự án, thẩm định thiết kế kỹ thuật, tổng dự toán công trình xây dựng do Tổng công ty quản lý và đầu tư;
- Sản xuất, kinh doanh vật liệu xây dựng.

 Tư vấn:
- Xây dựng thủy lợi, cấp thoát nước; đầu tư thiết bị; chuyển giao công nghệ trong lĩnh vực cơ điện, xây dựng nông nghiệp, lâm nghiệp, diêm nghiệp và thủy lợi.

Nghiên cứu khoa học và công nghệ; đào tạo  đội ngũ cán bộ, công nhân kỹ thuật về cơ điện và xây dựng nông nghiệp, lâm nghiệp, diêm nghiệp và thủy lợi.

 Các hoạt động kinh doanh khác:

- Vận tải và đại lý vận tải;

- Đầu tư, kinh doanh nhà ở, khách sạn, du lịch;

- Xuất nhập khẩu trực tiếp các mặt hàng theo yêu cầu kinh doanh của Tổng Công ty;

- Dịch vu cho thuê văn phòng, kho bãi, nhà xưởng, trưng bày sản phẩm.

- Đưa người lao động đi làm việ có thời hạn ở nước ngoài;

- Dịch vụ và thủ tục hải quan;

- Tiếp nhận và thực hiện các dự án hỗ trợ đầu tư phát triển.

Liên doanh, liên kết với các tổ chức kinh tế trong và ngoài nước để phát triển sản xuất, kinh doanh của Tổng Công ty.