Công ty CP Cơ điện Trần Phú có tiền thân được sáp nhập từ hai xí nghiệp (Xí nghiệp Cơ khí Xây dựng và Xí nghiệp Cơ khí Trần Phú) rồi lấy tên là Xí nghiệp Cơ khí Xây dựng Trần Phú. Thực hiện Nghị định số 388/HĐBT của Hội đồng bộ trưởng thành lập lại doanh nghiệp Nhà nước, Xí nghiệp Cơ khí Xây dựng Trần Phú được thành lập và lấy tên là Nhà máy Cơ điện Trần Phú. Để phát triển quy mô sản xuất lớn, Nhà máy Cơ điện Trần Phú được đổi tên thành Công ty Cơ điện Trần Phú vào cuối năm 1995. Đến năm 2004, thực hiện chủ trương sắp xếp đổi mới doanh nghiệp Nhà nước của TP. Hà Nội, Công ty Cơ điện Trần Phú chuyển thành Công ty TNHH Nhà nước một thành viên Cơ điện Trần Phú. Công ty được cổ phẩn hoá vào năm 2010 với số vốn điều lệ ban đầu là 56 tỷ đồng, sau đó tăng lên 78,4 tỷ đồng vào năm 2014.