Công ty được thành lập năm 1998 dưới hình thức công ty TNHH với vốn đăng ký ban đầu là 250 triệu đồng. Năm 2005, công ty được cổ phần hóa và tăng vốn điều lệ lên 6,2 tỷ đồng. Trong quá trình hoạt động, công ty liên tục tăng vốn, mở rộng sản xuất kinh doanh. Đến tháng 10 năm 2015, công ty chính thức đổi tên thành Công ty CP Tập đoàn PAN với vốn điều lệ là 1.008.724.970.000 đồng.

So với cùng kỳ năm 2016, doanh thu hợp nhất của Tập đoàn Pan tăng trưởng 48% vào năm 2017. Trong đó, doanh thu PAN Food hợp nhất tăng trưởng 88%, doanh thu PAN Farm hợp nhất tăng 15%. Tại thời điểm 31.12.2017, tổng tài sản của Tập đoàn đạt 5.982 tỉ đồng, tăng 59% so với đầu năm. Năm 2017, PAN đầu tư mở rộng quy mô sản xuất những sản phẩm chưa đủ đáp ứng nhu cầu thị trường như hoàn thành cụm nhà máy PAN Food Manufacturing, tăng số lượng sản phẩm cũng như diện tích canh tác của Công ty Cổ phần Giống cây trồng Trung Ương (NSC) và PAN - Saladbowl (PSB), tăng vốn và mở rộng 584 Nha Trang, hoàn thành và đưa vào sản xuất dự án kẹo mềm Hifat và bánh Cracker của Bibica, thực hiện M&A một số công ty để hoàn thiện chuỗi giá trị...

Năm 2018, PAN tiếp tục mục tiêu tăng trưởng với chỉ tiêu doanh thu hợp nhất đạt 8.786 tỉ đồng, tiếp tục chiến lược M&A chi phối trong các công ty có thế mạnh trong lĩnh vực nông nghiệp, thủy sản và thực phẩm. Đến năm 2022, mục tiêu của PAN sẽ đạt quy mô doanh thu khoảng 1 tỉ USD, lợi nhuận sau thuế đạt khoảng 95-100 triệu USD, trở thành một trong những công ty hàng đầu Việt Nam và khu vực trong lĩnh vực nông nghiệp và thực phẩm.