Tiền thân của Công ty CP Thủy sản Minh Hải là công ty quốc doanh với tên ban đầu là Chi nhánh Seaprodex Minh Hải được thành lập năm 1988. Năm 1993, công ty đăng ký lại theo Nghị định 388/CP với tên mới là Công ty Kinh doanh Xuất nhập khẩu Thủy sản Minh Hải. Công ty Kinh doanh Xuất nhập khẩu Thuỷ sản Minh Hải đã chính thức trở thành công ty CP vào tháng 4 năm 2002 với số vốn điều lệ là 15 tỉ đồng.