Chi cục Hải quan cửa khẩu Hoàng Diệu là đơn vị trực thuộc Cục Hải quan tỉnh Bình Phước có chức năng trực tiếp thực hiện các quy định quản lý Nhà nước về Hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu, phương tiện vận tải xuất cảnh, nhập cảnh; tổ chức thực hiện pháp luật về thuế và thu khác đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu; phòng, chống buôn lậu, gian lận thương mại, vận chuyển trái phép hàng hóa qua biên giới; phòng, chống ma tuý trong phạm vi địa bàn Hải quan theo quy định của pháp luật.
- Chi cục Hải quan cửa khẩu Hoàng Diệu có tư cách pháp nhân, có trụ sở, con dấu và tài khoản riêng tại Kho bạc Nhà nước theo quy định của pháp luật.
- Chi cục HQCK Hoàng Diệu được thành lập theo Quyết định số 102 ngày  05 tháng 09 năm 1991 của Tổng cục trưởng Tổng cục Hải Quan về việc thành lập Chi cục Hải quan cửa khẩu Hoàng Diệu; Chi cục Hải quan cửa khẩu Hoàng Diệu được nâng cấp từ cửa khẩu phụ lên cửa khẩu chính theo Quyết định số 1854/QĐ-TTg ngày 11 tháng 11 năm 2009 của Thủ tướng Chính phủ. Ngày 03 tháng 3 năm 2010, Bộ ngoại giao đã phối hợp với Ủy ban nhân dân 2 tỉnh Bình Phước và Mundulkiri tổ chức lễ khai trương cặp cửa khẩu chính Hoàng Diệu – Laphakhê.
- Chi cục HQCK Hoàng Diệu thực hiện chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn theo Quyết định số 1169/QĐ-TCHQ ngày 09/06/2010 của Tổng cục trưởng Tổng cục Hải quan về việc quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn, cơ cấu tổ chức của Chi cục Hải quan trực thuộc Cục Hải quan tỉnh, liên tỉnh, thành phố; theo quy định của Luật Hải quan, các quy định khác của pháp luật có liên quan và những nhiệm vụ quyền hạn cụ thể sau đây:
1. Thực hiện thủ tục hải quan, kiểm tra giám sát hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu, phương tiện vận tải xuất cảnh, nhập cảnh theo qui định của pháp luật.
Chi cục Hải quan cửa khẩu Hoàng Diệu thực hiện thủ tục Hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu được thông quan tại cửa khẩu Hoàng Diệu; bao gồm các loại hình sau:
- Hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu kinh doanh;
- Hàng tạm nhập-tái xuất, tạm xuất-tái nhập.
- Hàng hoá xuất khẩu, nhập khẩu biên giới;
- Phương tiện vận tải xuất cảnh, nhập cảnh.
- Hành lý của hành khách xuất cảnh, nhập cảnh;
- Hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu phi mậu dịch;
- Hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu khác theo quy định của pháp luật.
2. Thực hiện kiểm soát hải quan để phòng, chống buôn lậu, chống gian lận thương mại, vận chuyển trái phép hàng hóa qua biên giới, phòng, chống ma tuý trong phạm vị địa bàn hoạt động của Chi cục Hải quan cửa khẩu Hoàng Diệu.
Phối hợp với các lực lượng chức năng khác để thực hiện công tác phòng, chống buôn lậu, gian lận thương mại, vận chuyển trái phép hàng hóa qua biên giới ngoài phạm vi địa bàn hoạt động của Chi cục.
3. Tiến hành thu thuế và các khoản thu khác theo quy định của pháp luật đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu; thực hiện việc ấn định thuế, theo dõi, thu thuế nợ đọng, cưỡng chế thuế và phúc tập hồ sơ hải quan; đảm bảo thu đúng, thu đủ, nộp kịp thời vào ngân sách Nhà nước.
4. Thực hiện thống kê Nhà nước về Hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu và phương tiện vận tải xuất cảnh, nhập cảnh thuộc phạm vi quản lý của Chi cục.
5. Tổ chức thực hiện triển khai việc ứng dụng tiến bộ khoa học, công nghệ và phương pháp quản lý hải quan hiện đại vào hoạt động của Chi cục.
6. Thực hiện cập nhật, thu thập, phân tích thông tin nghiệp vụ Hải quan theo quy định của Cục Hải quan tỉnh và của Tổng cục Hải quan.
7. Thực thi bảo hộ quyền sở hữu trí tuệ theo quy định của pháp luật.
8. Thực hiện việc lập biên bản, ra quyết định tạm giữ người theo thủ tục hành chính, tạm giữ hàng hóa, tang vật, phương tiện vi phạm hành chính về hải quan và xử lý vi phạm hành chính về hải quan; giải quyết khiếu nại quyết định hành chính, hành vi hành chính và giải quyết tố cáo theo thẩm quyền Chi cục được pháp luật quy định.
9. Kiến nghị với các cấp có thẩm quyền những vấn đề cần sửa đổi, bổ sung về chính sách quản lý nhà nước về hải quan với hoạt động xuất khẩu, nhập khẩu, xuất cảnh, nhập cảnh và chính sách thuế đối với hàng hoá xuất khẩu, nhập khẩu, các quy định, quy trình thủ tục Hải quan và những vấn đề vượt quá thẩm quyền giải quyết của Chi cục.
10. Phối hợp chặt chẽ với các cơ quan Nhà nước, tổ chức hữu quan trên địa bàn hoạt động Hải quan để thực hiện nhiệm vụ được giao.
11. Tổ chức tuyên truyền, hướng dẫn thực hiện chính sách, pháp luật về Hải quan cho các tổ chức, cá nhân có hoạt động xuất, nhập khẩu trên địa bàn.
12. Thực hiện hợp tác quốc tế về Hải quan theo phân cấp hoặc uỷ quyền của Bộ trưởng Bộ Tài chính và Tổng cục trưởng Tổng cục Hải quan.
13. Thực hiện các quy định về quản lý cán bộ công chức và quản lý tài chính, tài sản, các trang thiết bị của Chi cục theo phân cấp của Tổng cục Hải quan và Cục Hải quan tỉnh.
14. Tổ chức thực hiện các chế độ báo cáo và cung cấp thông tin về hoạt động của Chi cục Hải quan theo quy định của Cục Hải quan tỉnh và Tổng cục Hải quan.
15. Thực hiện các nhiệm vụ cụ thể khác do Cục trưởng Cục Hải quan tỉnh giao.